Caracterização molecular de etnovariedades de Manihot esculenta Crantz com utilização de marcadores moleculares ISSR

Autores

  • Giovana Cuchi Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado
  • Elisa dos Santos Cardoso Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado
  • Eliane Cristina Moreno de Pedri Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado
  • Auana Vicente Tiago Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado
  • Kelli Évelin Müller Zortéa Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado
  • Ana Aparecida Bandini Rossi Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado

DOI:

https://doi.org/10.53660/CONJ-1705-2H70

Palavras-chave:

Mandioca, Marcadores moleculares, Diversidade genética

Resumo

A mandioca (Manihot esculenta) é amplamente distribuída no Brasil, nas roças encontram-se plantas com características diferentes que são mantidas e propagadas entre os agricultores. Levando em consideração a diversidade de etnovariedades encontrada, esse trabalho teve como objetivo realizar a caracterização molecular de etnovariedades de mandioca cultivadas no município de Paranaíta - MT, utilizando primers ISSR. O material foliar foi coletado em oito propriedades de Paranaíta. A extração de DNA foi realizada por meio do método CTAB e as amostras amplificadas via PCR. Foram utilizados 14 primers ISSR que após análise estatística foram classificados como moderadamente informativos. A comparação entre as informações cedidas pelos produtores e as distâncias genéticas entre as etnovariedades, permite inferir que a diversidade entre as mesmas está relacionada a história evolutiva da espécie. Os métodos de agrupamento utilizados indicam que dentre as etnovariedades analisadas, duas apresentaram potencial para estudos futuros por serem mais distantes geneticamente entre as demais.

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Biografia do Autor

Giovana Cuchi, Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado

Graduanda em Ciências Biológicas na Universidade do Estado de Mato Grosso, Campus de Alta Floresta.

Elisa dos Santos Cardoso, Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado

Professora da Rede Estadual de Educação do Estado de Mato Grosso. Licenciada em Ciências Biológicas pela Universidade do Estado de Mato Grosso (UNEMAT) e Licenciada em Química pelo Instituto Federal de Mato Grosso (IFMT). Especialista em Biologia Geral pela Universidade Federal de Lavras (UFLA) e mestre em Biodiversidade e Agroecossistemas Amazônicos pelo PPGBioAGRO da Universidade do Estado de Mato Grosso, campus de Alta Floresta. Doutora em Biodiversidade e Biotecnologia pela Rede Bionorte.

Eliane Cristina Moreno de Pedri, Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado

Licenciada em Ciências Biológicas pela Universidade do Estado de Mato Grosso (UNEMAT/AFL); Doutora em Biodiversidade e Biotecnologia pela Rede Bionorte.

Auana Vicente Tiago, Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado

Graduada em Licenciatura em Ciências Biológicas, pela Universidade do Estado de Mato Grosso (2013/1). Mestre em Biodiversidade e Agroecossistemas Amazônicos pela Universidade do Estado de Mato Grosso (2016/1). Doutora em Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal - Rede BIONORTE, Universidade do Estado de Mato Grosso (2020/1). Atualmente é Pesquisadora na Embrapa Agrossilvipastoril no Programa de Desenvolvimento Científico e Tecnológico Regional (PDCTR) - FAPEMAT/CNPq (2022-2025).

Kelli Évelin Müller Zortéa, Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado

Doutora em Biodiversidade e Biotecnologia pelo BIONORTE. Graduada em Ciências Biológicas pela Universidade do Estado de Mato Grosso (2010). Especialista em Avaliação de Impactos Ambientais e Recuperação de Áreas Degradadas pela Faculdade de Ciências Sociais e Aplicadas de Diamantino (2012) e em Saneamento Ambiental pela AVM Faculdade Integrada (2015). Mestra em Genética e Melhoramento de Plantas pela Universidade do Estado de Mato Grosso (2018). Atualmente é professora contratada na Universidade do Estado de Mato Grosso (UNEMAT) no campus de Alta Floresta, atuando nos cursos de Ciências Biológicas e Agronomia. Atua nas áreas de Genética Vegetal, Biologia Molecular, Biodiversidade Vegetal e Biotecnologia.

Ana Aparecida Bandini Rossi, Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado

Graduada em Ciências Biológicas pela Universidade do Estado de Mato Grosso (1996), mestrado em Botânica pela Universidade Federal de Viçosa (2003) e doutorado em Genética e Melhoramento pela Universidade Federal de Viçosa (2007). Atualmente é professora sênior da Universidade do Estado de Mato Grosso (UNEMAT). Tem experiência na área de Biologia Geral, com ênfase em Genética Vegetal, Biologia Molecular e Biologia da Conservação, atuando principalmente nos seguintes temas: Aspectos Reprodutivos e Diversidade Genética em espécies Vegetais Nativas e Cultivadas e conservação dos Recursos Naturais. Participa como orientadora dos Programas de Pós Graduação: Mestrado em Biodiversidade e Agroecossistemas Amazônicos, Genética e Melhoramento de Plantas e do Doutorado Biodiversidade e Biotecnologia da Amazônia Legal, da Rede Bionorte. 

Referências

ALLEM, A. C. The Origins and Taxonomy of Cassava. In: HILLOCKS, R. J.; THRESH, J. M.; BELLOTTI, A. C. (Eds). Cassava: Biology, Production and Utilization. 2002. p. 1–16. DOI: 10.1079/9780851995243.0001

ALVARES, C. A. et al. Köppen’s climate classification map for Brazil. Meteorologische Zeitschrift, v. 22, n. 6, p. 711–728, 2013. DOI: 10.1127/0941-2948/2013/0507

BOTSTEIN, D. et al. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetics, v. 32, p. 314–331, 1980. Disponível em: <https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1686077/>. Acesso em: 12 jul. 2022.

CANDOLLE, A. Plants cultivated for their subterranean parts, such as roots, tubercles, or bulbs. In: The Origin of Cultivated Plants. Cambridge University Press, 2012. p. 29–82. DOI: 10.1017/CBO9781139107365.004

CARDOSO, E. S. et al. Genetic diversity of Zingiber officinale (Zingiberaceae) germplasm grown in urban and rural backyards in Mato Grosso, Brazil. Genetics and Molecular Research, v. 19, n. 2, p. 1–12, 2020. DOI: 10.4238/gmr18576

COCK, J. H. Cassava: A basic energy source in the tropics. Science, v. 218, p. 755–762, 1982. DOI: 10.1126/science.7134971

CRUZ, C. D. Genes Software – extended and integrated with the R, Matlab and Selegen. Acta Scientiarum Agronomy, v. 38. n. 4. p. 547-552, 2016. DOI: 10.4025/actasciagron.v38i4.32629

DARDENGO, J. et al. Agrobiodiversidade em quintais agroflorestais no norte de Mato Grosso. Brazilian Journal of Development, v.8, n.1, p. 2578-2593, 2022. DOI: 10.34117/bjdv8n1-167

DOYLE, J. J.; DOYLE, J. L. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochemical Bulletin, v. 19, n. 1, p. 11–15, 1987.

EARL, D. A.; VONHOLDT, B. M. Structure Harvester: A website and program for visualizing Structure output and implementing the Evanno method. Conservation Genetics Resources, v. 4, p. 359–361, 2012. DOI: 10.1007/s12686-011-9548-7

EMPERAIRE, L.; PERONI, N. Traditional management of agrobiodiversity in Brazil: A case study of Manioc. Human Ecology, v. 35, n. 6, p. 761–768, 2007. DOI: 10.1007/s10745-007-9121-x

EVANNO, G.; REGNAUT, S.; GOUDET, J. Detecting the number of clusters of individuals using the software Structure: A simulation study. Molecular Ecology, v. 14, n. 8, p. 2611–2620, 2005. DOI: 10.1111/j.1365-294X.2005.02553.x

FIGUEREDO, P. E. et al. Diversidade genética de mandiocas na região periurbana de Sinop, Mato Grosso, Brasil. Magistra, v. 30, p. 143–153, 2019. Disponível em: <https://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1113281>. Acesso em: 12 jul. 2022.

FUKUDA, W. M. G. et al. Banco de germoplasma de mandioca: manejo, conservação e caracterização. Cruz das Almas: EMBRAPA-CNPMF. 1996. p. 103. (Documentos, 68). Disponível em: <https://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/641470>. Acesso em: 12 jul. 2022.

GERVAZIO, W. et al. Quintais agroflorestais urbanos no sul da Amazônia: os guardiões da agrobiodiversidade?. Ciência Florestal, v. 32, n. 1, p. 163-186, 2022. DOI: 10.5902/1980509843611

HAIR JUNIOR, J. F. et al. Análise multivariada de dados. 6. ed. Porto Alegre: Bookman, 2009. 688 p. Disponível em: <https://integrada.minhabiblioteca.com.br/books/9788577805341>. Acesso em: 11 jul. 2022.

HOFFMANN, L. V.; BARROSO, P. A. V. Marcadores Moleculares como Ferramentas para Estudos de Genética de Plantas. Campina Grande: Embrapa Algodão. 2006. p. 35. (Documentos, 147). Disponível em:<https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CNPA/18326/1/DOC147.pdf>. Acesso em: 12 jul. 2022.

IBGE. INSTITUTO BRASILEIRO DE GEOGRAFIA E ESTATÍSTICA. Cidades: Paranaíta, 2021. Disponível em: <https://cidades.ibge.gov.br/brasil/mt/paranaita/panorama>. Acesso em: 12 jun. 2022.

IBGE - INSTITUTO BRASILEIRO DE GEOGRAFIA E ESTATÍSTICA. Levantamento Sistemático de Produção Agrícola (SIDRA), 2022. Disponível em: <https://sidra.ibge.gov.br/tabela/1618#resultado>. Acesso em: 12 jun. 2022.

KRUSKAL, J. B. Multidimensional scaling by optimizing goodness of fit to a nonmetric hypothesis. Psychometrika, v. 29, n. 1, p. 1–27, 1964. DOI: 10.1007/BF02289565

MARTINS, E.; MACHADO, G. Análise do uso de diversas funções de similaridade no agrupamento de casos de teste baseados em modelos de estado. In: WORKSHOP DE TESTES E TOLERÂNCIA A FALHAS (WTF), 19., 2018, Campos do Jordão. Anais [...]. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2018. Disponível em: <https://sol.sbc.org.br/index.php/wtf/article/view/2389>. Acesso em: 11 jul. 2022.

MARTINS, M. L. L. et al. Manihot In Flora e Funga do Brasil. Jardim Botânico do Rio de Janeiro. Disponível em: <https://floradobrasil.jbrj.gov.br/FB17600>. Acesso em: 12 jun. 2022.

MARTINS, P. S. Dinâmica evolutiva em roças de caboclos amazônicos. Estudos avançados, v. 19, p. 209-220, 2005. Disponível em: <https://www.revistas.usp.br/eav/article/view/10055>. Acesso em: 23 jun. 2022.

MEYER, A. S. et al. Comparison of similarity coefficients used for cluster analysis with dominant markers in maize (Zea mays L). Genetics and Molecular Biology, v. 27, n. 1, p. 83–91, 2004. DOI: 10.1590/S1415-47572004000100014

MIRANDA, C. M. et al. Fingerprint de Variedades Elites de Mandioca via Marcadores ISSR. In: Congresso brasileiro de mandioca, 16. Congresso Latino-Americano e Caribenho de Mandioca, 2015, Foz do Iguaçu. Integração: segurança alimentar e geração de renda. Anais... Foz do Iguaçu: SBM, 2015. Disponível em: <http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1038497>. Acesso em: 24 jun. 2022.

MOJENA, R. Hierarchical grouping methods and stopping rules: an evaluation. The Computer Journal. v. 20. n. 4. p. 359-363, 1977. DOI: 10.1093/comjnl/20.4.359

OLIVEIRA, S. C.; BABINI, M. A Terminologia da Macaxeira: Constituição de um corpus. v. 15. p. 32–44, 2016. Disponível em: <https://seer.ufrgs.br/riterm/article/download/64323/pdf>. Acesso em: 12 jul. 2022.

PEDRI, E. C. M. et al. Genetic diversity of cassava landraces cultivated in northern Mato Grosso State, Brazil, using microsatellite markers. Genetics and Molecular Research, v. 18, n. 3, p. 1–11, 2019. DOI: 10.4238/gmr18315

PRECZENHAK, A. P. Diversidade Genética Estimada por meio de Marcadores Moleculares e Morfoagronômicos em Acessos de Mini-Tomate. 2013. 67 f. Dissertação (Mestrado). Universidade Estadual do Centro-Oeste, Guarapuava, 2013.

PRITCHARD, J. K.; STEPHENS, M.; DONNELLY, P. Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics, v. 155, p. 945–959, 2000. DOI: 10.1093/genetics/155.2.945

ROHLF, F. J. Adaptive Hierarchical Clustering Schemes. Systematic Zoology, v. 19, n. 1, p. 58–82, 1970. DOI: 10.2307/2412027

SEPLAN. Secretaria de Estado de Planejamento e Coordenação Geral. Mapa de Solos do Estado de Mato Grosso, 2001. 1 mapa. Escala: 1:1.500.000. Disponível em: <http://geoportal.seplan.mt.gov.br/metadados/srv/api/records/4e880b8e-070e-48d2-8ad4-b97febc4399f/attachments/DSEE-PD-RT-004-A001.pdf>. Acesso em: 23 jun. 2022.

SILVA, A. R. da. Métodos de agrupamento: avaliação e aplicação ao estudo de divergência genética em acessos de alho. 2012. 67 f. Dissertação (Mestrado). Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2012.

SILVA, K. V. P. et al. Variabilidade genética entre acessos do gênero Manihot por meio de marcadores moleculares ISSR. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 46, n. 9, p. 1082–1088, 2011. DOI: 10.1590/S0100-204X2011000900016

SILVA, R. M. et al. Biologia reprodutiva de etnovariedades de mandioca. Scientia Agricola, v.58, n. 1. p.101-110, 2001. DOI: 10.1590/S0103-90162001000100016

TIAGO, A. V. et al. Genetic diversity in cassava landraces grown on farms in Alta Floresta-MT, Brazil. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 3, p. 1–10, 2016. DOI: 10.4238/gmr.15038615

VINUTO, J. A amostragem em bola de neve na pesquisa qualitativa: um debate em aberto. Temáticas, v. 22, n. 44, p. 203–220, 2014. DOI: 10.20396/temáticas.v22i44.10977

ZANETTI, G. T. Aspectos reprodutivos e diversidade genética de pau-de-balsa (Ochroma pyramidale Cav. ex Lam. Urb., Malvaceae). 2020. 89 f. Dissertação (Mestrado). Universidade do Estado de Mato Grosso Carlos Alberto Reyes Maldonado, Sinop, 2020. Disponível em: <http://portal.unemat.br/media/files/Disserta%C3%A7%C3%A3o%20-%20G%C3%A9ssica%20Tais%20Zanetti%20(1).pdf>. Acesso em: 12 jul. 2022.

ZEVEN, A. C. Landraces: A review of definitions and classifications. Euphytica, v. 104, p. 127–139, 1998. DOI: 10.1023/A:1018683119237

ZORTEA, M. et al. Quintais agroflorestais urbanos: refúgio de resiliência?. Educação Ambiental em Ação, v. 17, n. 66, 2018. Disponível em: <http://www.revistaea.org/artigo.php?idartigo=3513>. Acesso em: 11 jul. 2022.

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Publicado

2022-09-29

Como Citar

Cuchi, G., Cardoso, E. dos S., Pedri, E. C. M. de ., Tiago, A. V. ., Zortéa, K. Évelin M., & Rossi, A. A. B. (2022). Caracterização molecular de etnovariedades de Manihot esculenta Crantz com utilização de marcadores moleculares ISSR. Conjecturas, 22(13), 747–764. https://doi.org/10.53660/CONJ-1705-2H70

Edição

v. 22 n. 13 (2022): Especial Mais Ciência

Seção

Artigos

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